1949年经薛城县批准，在鲍沟一村建立卫生联合诊所，设在原鲍沟一村高家老宅，分中西医两科，有工作人员9人，是全民性质的基层最早的卫生机构。吴彦公任所长。

1959年6月，由高家老宅迁往鲍沟三村赵家老宅，鲍沟卫生所改称为鲍沟人民公社卫生院，职工扩大到30人。分中西医、化验、中药、西药五个科室，病床8-10张。吴彦公、彭关梁先后任院长。

1966年春由赵家老宅迁往现址，当时全是砖瓦起脊房，职工40多人，病床28张，分中医、西医、内科、中药、西药、化验、药械、放射、妇产、护理、防疫等科室。1965年6月，张贵德主持工作。

1979年7月搬至老门诊楼（现为公卫楼），1984年改称鲍沟镇卫生院。是年4月，张广志任院长，主持工作。

 1986年，医院由县划归鲍沟镇人民政府管理。是年9月，孟昭信任院长。

1992年，被枣庄市卫生局评定为“合格乡镇卫生院”。1989年7月，钟士科任院长。

1993年，在医院分级管理评审中定为“一级甲等医院”。1994年3月，蒋道新任院长，主持工作。1995年，经省卫生厅批准，确定为中心卫生院。1996年6月，苗广海任院长。

1997年，被命名为“爱婴医院”。 1999年6月、2000年6月、2002年3月，2005年6月，鲍庆顺、王延波先后任院长。

2004年被确定为省级新型农村合作医疗试点医院。2005年6月，王延岱任院长，主持工作；2008年9月，孟建博任院长。

2012年，被山东省卫生厅命名为“山东省中医药特色乡镇卫生院”。2013年1月，王刚接任院长，郭涛任党支部书记。2015年12月，黄士斌任院长。

2018年8月，续军接任院长，主持工作。

2021年11月，张栋接任院长，孙利锋任党支部书记。